Niestety, nie było dane Ramzesowi wypoczywać wewnątrz spokoju, jako to mu życzono, na zawsze. Już wewnątrz początkach XXI dynastii, z obawy przedtem profanacją plus obrabowaniem królewskiego ciała, przypadkiem kapłan Pinodżem polecił po cichu przenieść doczesne szczątki Ramzesa do wnętrza bezpieczne miejsce. Przy tej okazji mumia Ramzesa została poddana zabiegom konserwacyjnym. Ponownie owinięto ją bandażami dodatkowo nasączono środkami zabezpieczającymi. Została złożona z początku wewnątrz grobowcu Setiego I, tudzież następnie do wnętrza wyniku dalszych obaw, wewnątrz tajemnym grobowcu królowej Inhapi – znanym współcześnie jak Skrytka DB-320 wewnątrz Deir el-Bahari, gdzie spoczywała u boku mumii królowej Nefertari – pierwszej Wielkiej Małżonki Królewskiej Ramzesa – na wskroś tuż tuż 3000 lat.
Skrytka DB-320 została odkryta wewnątrz 1881 roku oraz wszystkie znajdujące się do wnętrza niej królewskie mumie zostały przewiezione do Muzeum Egipskiego wewnątrz Kairze. Tam do wnętrza obecności Gastona Maspero i wicekróla Egiptu – Taufika, dokonano oględzin mumii Ramzesa. Odczytano hieratyczne inskrypcje, znajdujące się na wieku trumny również całunie, którym była okryta mumia. Oprócz imienia, znajdował się w tym miejscu podobnie niedbały zobrazowanie losów mumii. Inskrypcja głosiła: "Rok siedemnasty, miesiąc trzecia część drugiej pory, (Peret – przyp. autora) dzień szósty. Dzień przeniesienia Ozyrysa, Króla Usermaatre Setepenre, w środku celu pochowania go do wnętrza grobie Ozyrysa, Króla Menmaatre, na wskroś Wielkiego Kapłana Amona, Pinodżema"[33]. Identyfikacji dokonano na podstawie hieratycznej inskrypcji, zapisanej na całunie, przykrywającym mumię.
Po rozwinięciu bandaży uczonym ukazało się charakter zmarłego króla. Zmumifikowane zgromadzenie zachowało się wewnątrz doskonałym stanie. Rysy twarzy, wciąż wyraziste, zdradzały siłę woli dodatkowo charakteru zmarłego władcy. Na twarzy widoczne poprzedni pozostałości zarostu, oraz głowę pokrywały kręcone, rudo-blond włosy (pierwsi faraonowie mogli oczekiwać w przeciwnym razie niż dzisiejsi społeczeństwo Egiptu - jasne włosy zachowały się na wielu mumiach, są też widoczne na różnych wizerunkach z tego okresu).
Mumię umieszczono do wnętrza szklanej gablocie oraz wystawiono na widok, zwiedzających muzeum turystów. Już w środku 1912 roku, medyk Elliot Smith, w toku prowadzenia badań mumii, zauważył zupa oznaki jej rozkładu.